Uma das finalidades da Ebserh é a prestação de serviços gratuitos de assistência médico-hospitalar, ambulatorial e de apoio diagnóstico e terapêutico à comunidade. Essas atividades de prestação de serviços de assistência à saúde estão inseridas integral e exclusivamente no âmbito do Sistema Único de Saúde - SUS.

Dentre outras competências, a Ebserh deve administrar unidades hospitalares, bem como prestar serviços de assistência médico-hospitalar, ambulatorial e de apoio diagnóstico e terapêutico à comunidade, no âmbito do SUS;

No desenvolvimento de suas atividades de assistência à saúde, a Ebserh observa as orientações da Política Nacional de Saúde, de responsabilidade do Ministério da Saúde.